Satorini posee un clima Mediterraneo con una temperatura promedio anual de 18°C. Los meses de veranos (Mayo a Octubre) son calurosos y largos, y la temperatura puede llegar hasta los 34°C. Las precipitaciones leves se presentan en los meses de Noviembre a Marzo y los inviernos son suaves y cortos, con una temperatura mínima de 9°C. La mejor época para poder visitar la ciudad es en la temporada de primavera, finales de verano y comienzo de otoño.